En lugar de continuar en Halle, Zinzendorf prosiguió sus estudios universitarios en Wittenberg siguiendo las instrucciones de su tutor. Este fuerte dominio de la ortodoxia luterana no era un terreno amistoso para los pietistas, pero era el lugar adecuado para que un hijo noble se preparara para el servicio de la corte. La abuela del conde, preocupada por su inclinación hacia el ministerio, le dijo con severidad que su lugar estaba al servicio del estado. Hamilton, en su Historia de la Iglesia Morava, señala cómo Otto Christian emitió instrucciones precisas “respetando la conducta y los estudios” de Zinzendorf. Una muestra del diario de Zinzendorf revela cómo su tutor le había planificado su día y cómo su «religión del corazón» estaba claramente intacta a los 15 años:
Esta semana comencé el plan de pasar una hora entera, de seis a siete de la mañana, así como por la tarde de ocho a nueve, y durante quince minutos a las diez menos cuarto, en oración. También resolví seguir con todas mis energías los estudios de derecho civil, ya que espero todo tipo de interrupciones este próximo verano. Exámenes con Mencken. A las diez en punto hice esgrima. A las once estudié los pandectos. A las doce cené. En una jugaba bádminton (schlug volants). A las dos dibujé. A las tres asistí a una conferencia sobre la historia del Reich. A las cuatro bailé. A las cinco estaba aquí Bardin (tutor de francés). A los seis estudié derecho civil. A las siete cené. A las ocho recé. A los nueve estudié el examen de Hoppi.
Hamilton señala que en Wittenberg «sus prejuicios hallensianos contra las autoridades de Wittenberg se disiparon… se animó a apreciar a estos hombres». Fiel a su “obsesión” por la unidad de los cristianos, cuando todavía era estudiante, hizo un gran esfuerzo para reconciliar a Francke y los eruditos de Wittenberg, pero fue en vano. Zinzendorf siempre fue pietista de corazón y se entristeció más tarde cuando el hijo de Francke y sucesor en Halle se opuso a lo que estaba haciendo en Herrnhut.
Como era habitual en la época, Zinzendorf completó sus estudios en Wittenberg al embarcarse en una “gran gira” por los centros de aprendizaje del continente. Primero, en compañía de su medio hermano, Friedrich Christian, asistió a conferencias en Holanda, estudió inglés y visitó ciudades holandesas. Luego, en 1720, él y su tutor fueron a París, donde permaneció durante seis meses. Recorrió el lujoso palacio de Versalles, pero quedó más impresionado con el trabajo de socorro realizado en un hotel de París. Aquí se forjó un fuerte vínculo de amistad con el primado de la arquidiócesis católica romana, el cardenal Noailles. Expuesto a las bellas artes y las riquezas culturales, su corazón se inclinaba cada vez más hacia el Salvador, cada vez menos hacia los intereses mundanos.